2009/1/1社區愛心日活動-創意香皂DIY

2009/1/1 「一砂一世界、看行十三行」學習體驗活動

2009/1/27春牛年曆版畫

2009/2/1 「石在愛現-Ipay邀你來佈展」學習體驗活動

2009/3/20本館志工台北盆地地質生態研習

2009/3/28配合館慶活動，每週六日舉辦考古電影院欣賞。

2009/3/31召開諮詢委員會。

2009/5/1 「舢舨船DIY」學習體驗活動

2009/6/20本館志工原住民文化研習（一）

2009/7/1「海底古樂園-萬花筒DIY」學習體驗活動

2009/7/11 2009年太陽祭活動熱鬧登場。

2009/7/11-2009/11/26 「發現初始-藝術與化石的對話戶外裝置藝術特展」開幕。

2009/7/11-2009/9/20第二特展室「海納-臺灣陸橋動物群特展」開幕。

2009/8/6-2009/8/30「臺灣文物數位博物館巡迴車特展」。

2009/8/30「浙江龍泉青瓷專業交流」

2009/9/5-2009/10/4第一特展室「千峰翠色-浙江龍泉青瓷特展」開幕。

2009/9/17「遺址監管及行政人員培訓班」

2009/9/20本館志工原住民文化研習（二）

2009/10/6-11/8第二特展室「躍出草原-寧夏岩畫特展」開幕。

2009/10/21-12/13第一特展室「前進歷史-水下考古特展」開幕。

2009/10/21-12/13「浮現-楊春森先生創作海底沉船意象戶外裝置藝術特展」。

2009/10/21「冬季星座辨認與獵戶座流星雨」天文營及夜宿博物館活動

2009/10/24「海的福善與暴戾-亞洲人類學與民俗學觀點」國際研討會

2009/11/13-2010/1/24第二特展室「臺北地區史前遺址珍寶-盧錫波先生收藏考古標本特展」開幕。

2009/11/20-11/28「防災教育行動博物館巡迴車特展」。

2009/11/21 2009年左岸藝術節熱鬧登場。

2009/11/21「古早勞動者-巡迴紙箱特展」。

2009/11/24「2009文化資產保存科學-出水遺物保存維護」國際研討會。

2009/11/29本館志工參訪-臺中霧峰林家花園研習參訪。

2009/12/7導覽人員培訓-形塑八里坌特色

2009/12/20本館志工圓山飯店文化研習

2009/12/21召開典藏政策與工作會議。

2009/12/29-2010/6/30「墾拓-漂流木創意大賞」。